教材の説明

この教材では、Bioconductorパッケージの作成方法の概要を説明します。

学習者は、Bioconductorパッケージが特別な理由、パッケージの作成を開始する方法、 およびそのパッケージの情報を広める方法を学びます。 この教材では、入門資料の説明、「ライブ」コーディング、を行います。 これらはすべて、以下のコンテンツを基にしています。

前提条件

  • Rの構文の基本的な知識
  • Githubアカウント

目標と目的

学習目標

  • パッケージ作成の目的を理解する
  • パッケージの基本的な構成要素について学ぶ
  • 初めてのシンプルなパッケージを開発する
  • バージョン管理に精通する

インストール

この教材では、Bioconductorバージョン3.12を使用します。

以下で、この教材に必要なパッケージをインストールできます。

library(BiocManager)
install(c("usethis", "biocthis", "roxygen2", "devtools", "goodpractice", "BiocCheck"))